根據(jù)細(xì)胞來源和細(xì)胞發(fā)育階段，可以分為胚胎干細(xì)胞（Embryonic stem cell,ESC）、圍產(chǎn)期干細(xì)胞（Perinatal Stem Cell,PSC）和成體干細(xì)胞（Adult stem cell,ASC）。

根據(jù)分化潛能，可分為全能干細(xì)胞（Totipotent stem cell,TSC）、多能干細(xì)胞（Pluripotential stem cell,HSC）和專能干細(xì)胞（Unipotent stem cell, USC）。