磁珠法細(xì)胞分選是基于磁珠上的官能團(tuán)，直接或間接地與細(xì)胞表面配體相互識別作用后，進(jìn)行特異性捕獲分離的。用于細(xì)胞分選的磁珠多為免疫標(biāo)記磁珠，即磁珠上直接或間接耦聯(lián)抗體，與目標(biāo)細(xì)胞表面抗原特異性識別。

直標(biāo)磁珠耦聯(lián)標(biāo)記抗體，可與細(xì)胞上的抗原識別結(jié)合，使磁珠直接與細(xì)胞連接，從而可通過磁性分離獲得目標(biāo)細(xì)胞；間標(biāo)磁珠耦聯(lián)通用官能團(tuán)，通過識別細(xì)胞上標(biāo)記的一抗，對目標(biāo)細(xì)胞進(jìn)行捕獲，常用的間標(biāo)磁珠有抗免疫球蛋白磁珠、抗生物素磁珠、抗鏈霉親和素磁珠和抗熒光素磁珠等。間標(biāo)磁珠擴(kuò)展了細(xì)胞分選范圍，研究者可使用自備的抗體或配體對目標(biāo)細(xì)胞進(jìn)行分離純化。